油墨水性聚氨酯树脂与其他领域所用的聚氨酯树脂在结构有所不同，传统聚氨酯主要以聚酯多元醇／聚醚多元醇与异氰酸反应生成端羟基聚氨酯树脂，分子结构中极性基团以氨基甲酸酯为主，分子内聚力不足以满足油墨用树脂成膜性能要求，因此油墨用聚氨酯树脂在传统的聚氨酯基础上引入脲基，以大幅提高树脂本身的内聚强度和成膜性。

水性聚氨酯树脂对软体基材优异的附着力和耐弯曲油墨用聚氨酯树脂分子链段中含有氨基甲酸酯、脲基甲酸酯、酯键、醚键等极性基团，与多种极性基材PET、PA等塑料表面的极性基团形成氢键，进而形成具有一定连接强度的接头。